ФГБУ «ФАГПССАП» создано в 2003 году. Среди основных задач Агентства - организация и проведение мероприятий по обеспечению государственной поддержки в сфере агропромышленного производства в соответствии с законодательством РФ, контроль за соблюдением порядка и условий предоставления средств из федерального бюджета. Агентство обеспечивает информационно-консультационную деятельность в рамках организации страхования в сфере агропромышленного производства, а также занимается изучением и обобщением опыта (в том числе и зарубежного) проведения сельскохозяйственного страхования и разработкой предложений по совершенствованию указанной деятельности с использованием новых механизмов и форм государственной поддержки страхования в сфере агропромышленного производства.